治疗性应用时提高微生物标本送检率，有助于争取病原治疗，从而更有针对性、更有效、安全和经济地治疗患者。因此《2012年全国抗菌药物临床应用专项整治活动方案》中进一步提高了微生物标本送检率的要求。预防性应用抗菌药物时并不存在感染，因此不必进行微生物送检，专项整治方案中也未提出相关要求。有条件的单位，可以对一些有重要意义的耐药菌如MASA的定植进行主动筛查。