葡萄膜色素变性不论其生在虹膜睫状体还是脉络膜，均可表现为色素脱落或色素囤积病灶，其原因可为外伤、青光眼发作、糖尿病、视网膜脱离、黑色素瘤等。鉴别诊断应根据病史、临床特征。至于外伤后发生的血源性色素膜沉着，亦可列入色素变性，葡萄膜脂肪变性、坏死、骨化等可发生于炎症或循环障碍性疾病，一般只能根据病理切片作出鉴别。