治疗非淋病性尿道炎用敏感抗菌性治疗，但疗程要长，治疗期间禁止性生活。其配偶也需相应治疗。可选用红霉素每次0.5g，1天4次，7天后减为0.25g，1天4次，继续用14d，该方案尤适于孕妇。或用阿奇霉素每次0.5g，1天1次，7天一个疗程。或用左氧氟沙星每次0.2g1天2次，7~14天。疗程结束后1周需要复查。

　　本病可治愈，治疗过程中应避免性生活，以预防交叉感染和再感染。