匐行性角膜溃疡的主要症状可有异物感、刺痛感甚至烧灼感。球结膜混合充血，严重时伴有水肿。溃疡首先出现于角膜外伤后受损的部位。最初为灰白色或黄白色浓密浸润点，约米粒或绿豆大小。不久坏死脱落形成溃疡。溃疡四周围绕着灰暗色的水肿区，如溃疡未能控制，可继续向四周扩大，可达5~8mm。通常向中央一侧进行较显著。与此同时，溃疡面可向深部侵犯，形成实质脓肿。坏死组织不断脱落，角膜实质逐渐变薄，后弹力层膨出，最后导致溃疡穿孔。由于细菌毒素不断渗入前房，刺激虹膜睫状体，因此可出现严重的虹膜睫状体炎症状，早期即有前房浑浊和瞳孔缩小现象。角膜后出现灰白色或棕灰色粉末状沉着物，前房下方可有指甲状积脓出现，随着溃疡的扩大变深，积脓逐渐增多，有时可达前房一半以上。溃疡如在早期得到控制，留下较小的云翳，但较大的溃疡则留下致密的白斑，常伴有新生血管伸入，视力高度障碍。溃疡穿孔病例，则形成粘连性角膜白斑。大面积穿孔时，可以形成角膜局部或全部葡萄肿，常因继发性青光眼而导致无光感。倘有眼内感染时，最后形成眼球萎缩。