主要有以下三方面的意义：

　　①基因表达的时空隔离

　　在原核生物中,基因表达是连续进行的,即mRNA的转录和蛋白质的合成相偶联。这主要是因为原核细胞结构简单,原核生物的基因转录物无须经过剪接。真核生物的结构复杂,而且大多数基因都有内含子,转录后需要经过复杂的加工,所以核膜的出现,为基因的表达提供了时空隔离的屏障,便于DNA在核内活动的多样性。

　　②核膜作为保护性屏障,使核处于一微环境中细胞核是在进化过程中形成的。在细胞的遗传信息储存量越来越丰富以及由遗传信息所指导的代谢规模越来越大的情况下，有必要将携带遗传信息的染色质与细胞的其它部分隔离开来。核膜的出现，为细胞遗传信息的保存、复制、传递及发挥其对细胞代谢和发育的指导作用创造了特定的微环境，提高了上述各项活动的效率；避免直接受细胞内其它各种生命活动的干扰，并防止细胞中这个调度中枢的功能轻易地随环境条件的变化而变化，以保持其相对的稳定性，这些都是核膜出现的进化意义。

　　③染色体的定位和酶分子的支架染色质通过核纤层同核膜相连,使之多而不乱,保证了有序性。另外,核内的一些酶是以膜蛋白的形式存在的,这就有利于核内生化反应的区域化,从而发挥高度的催化活性。所以核膜是染色体和酶分子的支架和固着部位。