（1）在原核生物中，只有1种RNA聚合酶，负责合成所有的mRNA、tRNA和rRNA。

　　真核生物中有3种RNA聚合酶，即RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ，分别分布在核内的不同区域,完成不同的RNA的合成。

　　（2）原核生物相比，真核生物的RNA聚合酶转录时还需要有其他的很大一组蛋白质（转录因子）的协助，才能开始转录。

　　（3）真核生物mRNA一般为单顺反子结构，但其基因的原初转录产物（转录物）通常是由编码序列（外显子）和非编码序列（内含子）间插排列组成；原核生物为多顺反子。

　　（4）与原核生物mRNA不同，真核生物最初的mRNA转录物必须经过依次拼接除去内含子，再将有编码意义的各相邻外显子首尾相接，并进行修饰才能成为成熟的mRNA。

　　（5）5ˊ末端“戴帽”（capping），3ˊ末端加尾，链内某些核苷酸的甲基化。