迭部古称“叠州”，藏语的意思是“大拇指”，被称为是山神“摁”开的地方。

秦时，属陇西郡。

北周时置叠州。

汉武帝时，大将军李广征西，置武都郡。

唐贞观元年属陇右道。明、清属洮州卫、厅管辖。

民国年间为卓尼设治局管辖之迭部区。

解放后，属甘肃省卓尼自治区行政委员会辖属。

1962年1月1日，成立迭部县。