村后原有一座赤山头，山形似马鞍，“鞍”与“垵”谐音，故取名“后垵”。宋末元初，延陵吴氏平庵公从兴化平海卫（莆田）迁居仙境，再迁靖山（松茂），暂居于“戴厝埕”，最后卜居后垵赤山头边。“赤”即是“金”之意，故改为“金山”、又称“金峰”，成为后垵的雅称。

民国《台湾彰化吴氏金山衍派族谱》记载：“第一世始祖，肇居泉州府晋江县南关外二十四都龟湖后垵乡，地号金山，即金峰也。”

明代，因赤山头被吴氏视为家族风水山，按其山形，想象为玄龟，故后垵亦称为“龟山”。明末，后垵吴必达重修族谱，工部尚书林朝栋撰写《吴氏谱序》。称：“兹有龟山吴生必达以重修谱集，首举其事，请序于余。”林朝栋还以龟湖塘、天马山、赤山头等形胜赋诗一首以贺：

突兀双峰下，流光十里湖。

元龟拱北极，月马跃南都。

万石关家世，千枝汇图谱。

簪缨应不息，眼底识全吴。

清初，后垵吴氏东二房登缙公（1648—1724年），名弼，字伯绅，因条陈平海方略，得到总督姚启圣的器重。台湾平定后，吴弼入台求学，成为台湾凤山县“开台第一科岁进士（贡生）”，任福建松溪县儒学训导，参与编修《台湾府志》。吴弼第三子吴东龙定居彰化，为纪念祖籍来自“金山”，自称“金山溯源台瀛衍派”。

位于后垵附近的一个古村落，以位于龟湖鳌头之后而得名，又称“厚头”，记载于道光《晋江县志·铺递志》。

元代，曾氏聚居于此。清代《铺锦新厝黄氏旧谱》记载，铺锦三世祖黄君弼，卒于元至正二十六年（1366年），“葬本都（二十四都）厚头村凤峰山”。

后头曾氏至清代乾隆年间尚见于文献记载。清代《铺锦新厝黄氏旧谱》称，黄植北，字哲纯，生于乾隆二十七年（1762年），“娶后头曾氏”。

据说，民国年间，因为后头人口较少，耕地有限，某年遭遇瘟疫流行，村民患病死亡者甚多。幸存者陆续迁居到附近的山雅、后垵和蚶江锦里等地谋生，后头村落逐渐废弃，原有地界由后垵管辖。（