和龙远在上古三代为肃慎地；汉晋时期属挹娄地；北魏属勿吉地；隋代为靺鞨地；唐入渤海；明代属赓金河辖境，清初此地划为封禁地区，康熙五十三年（1714年），珲春协领设置后，今和龙县所辖地域隶属于珲春协领管辖。光绪十年（1884年）五月为办理吉林朝鲜通商事宜，于和龙峪地方设通商局。和龙峪一名始见于此。当时开和龙峪、、西步江为中朝互市地。光绪十一年（1885年）设置越垦局，光绪二十年（1894年），改设抚垦局，主要管理图们江北越垦地，初由珲春协领兼辖，光绪二十八年（1902年）十月延吉厅设置后，由延吉厅管辖，同年于和龙峪设分防经历一员，主管民政事务。宣统二年（1910年），和龙分防经历升置为县，始称和龙县，县治所在和龙峪（现为龙井智新乡驻地）。

民国三年（1914年）六月，国民政府重更道制，将吉林省划分为四道，和龙县划属吉林延吉道管辖。

民国十八年（1929年）。东北政务委员会成立，废道制，县归省直辖，本县直隶吉林省为三等县。伪满洲国成立之初仍承旧制，康德元年（1934年）伪满洲国改行帝制，实行地方行政机构改革，成立间岛省公署，和龙县由吉林省划归间岛省管辖，康德七年（1940年）七月县公署由大拉子移驻王道沟。一九四五年东北光复，同年九月成立和龙县临时政府，一九四六年一日成立和龙县政府，一九四九年九月成立和龙县人民政府，一九五三年九月三日延边朝鲜族自治州成立后，和龙县直接归属延边朝鲜族自治州管辖。

1993年7月5日经国务院批准设市（县级）。