据《义门区志》记载，“早在春秋战国、群雄逐鹿时代，义门属楚要塞，隶归城父县辖。唐天宝十年(公元七五一年)，设真源县。因是东汉梁国人孝子韩伯愈故里，故毫州知州张廷在此建立‘泣杖祠’而得‘伯愈故里’别称。清同治三年(公元一八六四年)，义门拨属涡阳县治。”义门有先有白龙庙而后才有的义门，白龙庙建于隋朝，毁于清朝同治年间。

唐天宝十年建立的真源县，在安禄山叛乱中遭到战火焚烧，真源县衙近剩一仪门。所以后人据此称之为“仪门镇”。义门俗名“庙集”，因为古时此地庙宇林立。到清朝来年为避宣统的名讳而改“仪门”为“宣门”。

民国成立之后，又复称义门。

解放战争结束后，虽然总体面积没有什么变化，但义门区划却几经更改。

1948年设义门区，归涡阳县管辖(此时涡阳县隶属于阜阳地区)，全区所辖范围一镇六乡。

1954年则有一镇十三乡，1958年则设一镇四乡，1961年建区划社，1970年撤区建社，1979年建区划社，这是最后一次建区。在这次建区之后，义门区全区呈葫芦形，东西较短，南北较长(东至杨三官庙；西至张营，与毫县隔沟相望；北至王店子，与牌坊相邻；南至小于庄，与标里搭界)。全区共辖五社一镇，其中的镇主要就是今日的义门镇。在上个世纪九十年代大规模的“撤区并乡”行政区划调整行动中，义门镇被划分为独立的建制镇，在行政等级上，只比县级低半级，是涡阳县行政级别最高的镇。同时，随着亳州的建市，义门镇的隶属关系也由

安徽省地区志编纂委员会．义门区志：黄山书社，1983．