夏商前21世纪至前11世纪属豫州。西周（前806年）属郑国。东周（前376年）属魏国。秦（前225年）属三川郡。西汉（前196年-公元25年）属兖州淮阳国（汉高帝十一年，设置扶沟县，扶沟名始此，现址催桥小扶城）。东汉（公元25年到公元100年） 该属陈留郡（今开封）。

三国魏 ，西晋（220年--266年 ）属兖州陈留郡（今开封）。东晋（317年）属豫州颍川郡（此年扶沟入新汲县，治所在汲乡，县城南迁改属颍川郡）。北魏（420年）属郑州部颍川郡（复置扶沟县），537年 属许昌郡。北齐，北周到隋（ 550-581年） 属扬州部颍川郡（隋大业末年，新汲县废，并入扶沟。移县治于桐丘，今城北石桥）。

唐（621年）属北陈州，其年改属洧州（其年废除北陈州，改置洧州，州治在尉氏），627年属许州（贞观元年，废洧州）742年属颍川郡（许州改颍川郡），758年属许州。后梁后唐后晋后汉后周（ 907年-951年）属东京开封府。宋（960年）属京畿开封府。金（1127年）属南京路开封府。元（1271年）属汴梁路总管府。明（1368年）属河南省开封府。清（1644年）属河南省开封府，1653年改属陈州府，1724年属直隶州，1734年复属陈州府。

至民国初，属河南开封道，民国十六年（1927年）改开封道为豫东行政区。

1947年，扶沟解放改属鄢陵建立的豫皖苏第五区，1949年归属淮阳专区，1953年改属许昌专区，1965年又设周口专区，扶沟归周口至今。