云山圩背靠屋背山，面临东乡河，每当冬春，晨雾缭绕，山藏于中，故名云山。清代，境域为长东乡的四十七至四十九都属地。

民国36年（1947年），属第三区（李渡区），新中国成立后，1953年后属第十一区（云山区）。

1958年，与甘陂、南溪乡合并成立云山人民公社。

1984年改称云山乡。

1994年建镇。

1997年，面积98平方千米，人口3.5万，辖云山、水田、甘陂、大源、库前、圳上、韩梅、洋坊、欧湖、周坊、骆仙、肖坊、南光、游源、石洋、杨泗、巷口、清溪、龚何、鄢坊、梅坊21个行政村。