据史书记载与考古发现，乌拉特后旗人类先祖活动的踪迹，可溯源到新石器时代。

从战国时起，这里就是匈奴牧地。

清顺治五年（1648年）清廷将这一带广大牧地封赐给乌拉特三公旗（乌拉特前旗、乌拉特中旗、乌拉特后旗，隶乌兰察布盟），自此乌拉特部始自呼伦贝尔移居于此。

中华人民共和国成立后，区划几经演变，1970年后始演为现境。