七股乡早期为台江内海的一部分，后来因曾文溪改道，台江内海逐渐陆化而形成陆地，渐有汉人进入开垦。清领时期，有七人合股在此开垦筑寮，于是称为“七股寮仔”或“七股寮”。

1920年台湾地方改制，在此地设置“七股庄”，归台南州北门郡管辖。战後改设台南县七股乡至今，曾是台湾重要的盐场所在，现在则因黑面琵鹭的造访而声名大噪。