伯利兹堡礁保护区位于伯利兹的大西洋——加勒比海海岸线上，北面与墨西哥毗邻，二者相距260公里，向南则与危地马拉接壤。因其是世界著名的生物礁聚集区，1996年作为世界自然遗产列入《世界遗产名录》，2009年列入《世界濒危遗产名录》。

世界遗产委员会描述：伯利兹海岸是一处风景绝佳的自然生态系统，由北半球最大的堡礁、近海环礁、几百个沙洲、美洲红树林、沿海泻湖、港湾组成。保护区内的七处景点展示了暗礁进化的历史，是包括海龟、海牛和美洲湾鳄在内的濒危物种的重要栖息地。

伯利兹堡礁是全世界第二大的活珊瑚礁，面积仅次于澳大利亚的大堡礁，是西半球最长的珊瑚礁。伯利兹堡礁位于尤卡坦半岛沿海一带，绵延300公里，包括中美洲国家伯利兹大部分的沿岸水域。除了由一群珊瑚礁组成的伯利兹堡礁外，保护区还有450个小礁岛，以及一些由三个环状珊瑚岛围绕着的泻湖。保护区分为7处，它们分别是：巴卡拉尔奇科国家公园及海岸保护区、蓝洞、半月礁自然保护区、南Wather礁海洋保护区、Glovers珊瑚礁海洋自然保护区、笑鸟礁国家公园、人心果礁海洋保护区，总面积为960平方公里，在世界遗产公约下得到特别保护。

保护珊瑚礁十分重要，因为全球百分之二十五的海洋植物和动物都以珊瑚为家。论到生物多样性，珊瑚礁的多元生态仅次于热带雨林。可是，科学家警告，要是人类继续污染海洋，不禁止游客破坏珊瑚，进行以氰化物捕鱼等破坏生态的活动，在未来的20至40年间，地球上百分之七十的珊瑚将会消失。

伯利兹堡礁保护区里共有70种石珊瑚，36种软珊瑚和500种鱼类。一些濒危绝种的海洋动物，例如红海龟、绿甲海龟、玳瑁、海牛和美洲鳄都在这里栖息。论到保护区里极丰富的海洋生物，珊瑚礁研究员祖莉安•鲁滨逊说:“伯利兹堡礁保护区让研究员和游客有很多独特的机会，探索自然界的奥秘…………世上只剩下很少地方像这里一样，能够让人观察自然界最美好的一面，不过这个自然景区也受到威胁。”

伯利兹堡礁保护区受到的最大威胁也许是珊瑚脱色，这种现象使原本彩色的珊瑚脱色变白。据美国《国家地理新闻》杂志报道，台风米奇、1997和1998年大规模的珊瑚脱色现象，使活珊瑚的数量减少了48%。是什么引致珊瑚大量死亡？这方面的研究仍在进行。但专门研究珊瑚礁的科学家梅勒妮•麦克费尔德指出:“这次珊瑚脱色相当肯定是跟海洋温度上升有关…………紫外线也会引起脱色现象，而两种因素同时出现就会引致最严重的脱色反应。”值得庆幸的是，伯利兹珊瑚礁似乎有慢慢复原的迹象。

伯利兹堡礁保护区一带的海水十分清澈，平均水温为摄氏26度，吸引了不少热爱深海潜水和浮潜的人。保护区百分之九十的地方仍未开发。堡礁距离安伯格里斯岛的圣佩德罗仅几百米，圣佩德罗的东南面6公里外是后晨海洋保护区，占地8平方公里，是个浅水的水底公园，珊瑚礁中有一个别具特色的小海峡。

蓝洞位于伯利兹堡礁保护区里的灯塔环礁区，距离伯利兹大陆约一百米，受到世界遗产条约保护，是全球数一数二的潜水胜地。1970年，法国海洋学家雅克—伊夫•库斯托乘坐卡吕普索号在这一带进行探险之旅，蓝洞自此闻名。蓝洞是个靛蓝色的石灰岩洞（落水洞），坐落在蓝绿色的海水中央，洞的周围长满珊瑚礁。蓝洞直径约300米，水深超过120米。在海平面上升前，这个特殊的海底洞穴原本是个干的地下岩洞，后来由于洞顶坍塌而形成了一个水下洞窟。蓝洞的洞壁十分陡峭，垂直下落至35米，巨大的钟乳石从该处的岩脊向下形成。水底的景象令人叹为观止，能见度达到60米。除了鲨鱼外，蓝洞里的海洋生物并不多。在这里作深海潜水的人浮上海面时要注意减压，经验较浅的人不宜冒险。但蓝洞珊瑚礁外围海水清澈，十分适合浮潜。

不远处是受到世界遗产条约保护的七个水域之一，就是恬静宜人的半月岛。这里是红脚鲣鸟的保护区，也是差不多98种鸟类的栖息地。半月岛峭壁深入海里1000米，长满美丽的软珊瑚，蔚为奇观，是潜水的天堂。

伯利兹生物礁被人类利用的历史悠久。滨海沿岸的玛雅遗址处，堆积着各种贝壳，鲜明的证实了大约2，500年前，生物礁就已经被用于渔业上了。公元前300年至公元900年之间，玛雅人广泛的使用滨海的水体，用于发展渔业，贸易支柱、庆典中心及埋葬地也都相继建造于此。在小巴卡拉尔水道处，至少有七处玛雅遗址，其中的几处遗址，如位于西海岸的三绢具有非凡的文化和历史意义。此外，保护区北界的巴卡拉尔运河是由玛雅商人于公元700年至900年间开凿的。随着玛雅文化的衰落，生物礁资源在数世纪中长期未受到有效的使用。直到17世纪初期，伯利兹沿岸水体才成为海盗们的天堂，这些海盗大部分是来自于英国，随后，许多海盗相继定居于此，逐渐发展成为渔民和种植园农场主。如今，障壁生物礁生态系统的主要用途是促进发展旅游业，仅仅1994年，来生物礁游览观光的游人就达128，000人，收入达7500万美元，游人在此可以尽情的享受各种娱乐活动。