汉元鼎六年（前111）属始安县。唐至德二年（757）属临桂县辖地，1913年属桂林县地。

1940年属桂林市凤北镇、西南附廓乡，1950年设第三区和北郊区，1955年改三皇、北站2街道，1958年改三皇、北站2公社，1966年更名东风、胜利公社，1979年东风、胜利公社合并置叠彩区。

1996年12月2日，国务院批准对桂林市市辖区的行政区划作相应调整：扩大叠彩区的行政区域，将原郊区大河乡、穿山乡的清风村划归叠彩区管辖。区政府驻凤北路。

2000年，叠彩区辖2个街道、1个乡。2006年1月6日，叠彩区人民政府从凤北路8号搬迁至中山北路147号。