三门县从新石器时代就有人类在这块土地繁衍生息。夏、商、周为瓯越地。春秋战国属越国，公元前306年，楚灭越，属楚国。秦朝，三门隶属闽中郡。

汉惠帝三年（公元前192年），三门县属东瓯国。建元六年，

三门县属会稽郡。汉昭帝始元二年（公元前85年），三门属回浦县，会稽郡。东汉光武帝时期（公元25年），三门属章安县。

三国吴大帝时期（公元222-252年）置临海县，三门属临海县，属会稽郡。吴少帝太平二年（公元257年），会稽郡东部置临海郡，三门属临海郡。

隋废郡为州，临海郡废改入处州，三门属临海县，隶吴州。隋炀帝大业元年（公元605年），又改州为郡，三门属永嘉郡。

唐武德元年（公元618年），临海县改海州，武德四年（公元621年）三门隶海州。武德五年（公元622年），改海州为台州，三门属台州。唐太宗贞观元年（公元627年），台州隶属江南道。唐肃宗乾元元年（785年），临海郡复称台州，隶属浙江东道。

宋朝神宗熙宁七年（公元1074年），分两浙路为两浙东路、两浙西路，时分属临海、宁海两县，隶台州。

元朝世祖至元十四年（公元1277年），改台州为台州路，隶属行中书省浙东道。

明朝地方政区制度袭元朝，改台州路为台州府。

清承袭明朝，设杭嘉湖、宁绍台、金衢严、温处四道，三门属临海、宁海两县，隶属浙江宁绍台道。

民国时期，三门分属临海、宁海两县。

民国二十九年（公元1940年）设置三门县，隶属台州行政督察区。

1949年2月17日三门解放，是浙江省第一个解放的县，隶属台州。

1954年5月22日三门县划归宁波管辖。

1957年7月三门县恢复属台州。

1983年5月，宁海县沙柳公社划归三门县。

1994年8月，经国务院批准，台州撤地建市，三门县隶属台州市至今。