建立环境管理体系，是企业实施ISO14000认证的必经之路，它既可由企业自己完成，也可聘请外部咨询机构帮助完成，或由双方共同完成。建立环境管理体系，必须以IS014001标准为规范，IS014004标准为指南，并结合国家的法律法规和环境标准。基本程序是当某一组织的最高管理者（层）决定申请环境管理体系认证后，根据IS014004标准的规定以及习惯上的操作程序，一般要经过：领导决策与准备、初始环境评审、体系策划与设计、体系文件编制、体系试运行、管理评审与持续改进等六个步骤或阶段。环境管理体系审核的主要目的是：根据组织已编制的环境管理体系文件及其运行情况，对照IS014001标准及所在国的环境法律、法规与标准，进行符合性审核。