杂交稻种的浸种催芽每年都会有个别农户因思想麻痹，不按育秧技术规程操作发生损种、损芽现象，因此造成不必要的经济损失。笔者通过多年观察，总结了杂交稻种发生损种损芽的原因，提出防治对策。
1损种损芽原因
1.1酒精中毒
在浸种吸水时，稻种以无氧呼吸为主，需氧量较少。一旦进入萌动，就转为以有氧呼吸为主，需氧量迅速增大，如果此时供氧不足，稻种被动地以无氧呼吸为主，造成体内酒精大量积聚，发生酒精中毒，种子发粘发臭引起损种损芽。如果稻种长期泡水，水源不能及时更新，水中溶氧量大幅下降，稻种就会发生酒精中毒。
1.2霉菌感染
每批种子中都有一些携带病菌的死种子，种子在浸泡过程中，好种子内容物及坏种子内养分不断渗出，如果水源不及时更新，水中养分不断积累，霉菌得到丰富营养得以大量繁殖，既直接感染好种子，又消耗水中氧气，间接引发酒精中毒。
1.3高温烧芽
种子崩胸至落谷，温度达35摄氏度以上，就会发生烧芽。种子崩胸前后，种子生理呼吸旺盛，种堆升温快，如果控温不及时，一旦超过35-40摄氏度，种子就失去生命力。在长根长芽期，如果种堆温度超过25摄氏度以上，根芽生长不健壮，重则烧芽，轻者播后“只长芽，不扎根”。搞薄膜覆盖的，在播种后，温度升高未能及时揭膜，旱秧薄膜下草层不厚，也易引起烧苗。
1.4缺氧闷芽
种子出苗期间需要充足的氧气，否则会发生出苗不齐的现象。如湿润育秧，秧板不沉实，种芽陷得深，出苗率就低，且出苗不齐，出苗推迟。薄膜育秧，如薄膜紧贴畦面，畦面下种子就会因缺氧而不能出苗。
1.5立枯死苗
种芽出苗后，气温低或温差过大，就可能发生立枯病及其它病害，造成死苗。如薄膜育秧、旱育秧，不上水陡揭膜，都可造成死苗。
另外，秧池基肥中化肥过多，造成土壤中氨气过多，秧苗根系中毒死苗；还有除草剂使用不当易造成死苗。
2防止损种损芽的主要技术措施
2.1做好发芽率
到信誉好的商家购买信得过的种子。在种子播种前，要做好发芽率检测,保证所用种子达国家标准。
2.2推广旱育秧
目前育秧方式有湿润育秧、薄膜育秧、温室育秧、旱育秧等多种方式。实践证明，旱育秧既能提高秧苗素质，增加有效穗，提高产量，又能节省用种，避免烧芽风险，节约成本。搞旱育秧可直接干籽播种，也可用药剂浸种一天一夜，种子漂洗干净后播种。
2.3把好浸种关
湿润育秧、薄膜育秧应当采用日浸夜露、活水浸种，种子不上窝的方法进行催芽。
2.3.1坚持单独浸种
杂交稻与常规水稻相比，颖壳薄，闭合度差，吸水快，进入萌动时间早。如果与常规水稻一起浸种、催芽，因较早进入萌动、高温崩胸期，就会发生酒精中毒或高温烧芽。因此，杂交稻种必须单独浸种。
2.3.2坚持药剂处理
根据当地农技部门要求，选用浸种灵、施保克、恶苗灵、强氯精等药剂浸种，可有效防治霉菌、立枯病菌、恶苗病菌的危害。在开始浸种时，即投入药剂，按照技术要求，根据温度、药剂种类及含量，确定好浸种浓度和时间，药剂浸种结束后，立即捞出种子，淘洗干净。
2.3.3坚持活水浸种
将药剂处理后的种子装入透气、透水性好的种袋中，每只袋子装种不超过5Kg，选择水质好、且向阳的流水河上层悬吊种袋，进行浸种。河水表层氧气足，温度高，有利于种子吸水和崩胸。在保证种子全部浸水的前提下，种袋要紧贴水面，越浅越好，底部决不能沾碰到河底。如果没有流水河，也可用缓缓流动的自来水代替活水，注意水层深度不超出10cm。
2.3.4坚持每天淘洗多次
浸种前用清水淘洗种子，剔除秕粒、病粒、米粒。活水浸种期间，每隔约3h将种子和种袋认真淘洗，清除沾着的病菌.
2.3.5坚持夜露不上窝
每天白天浸种（白天中午露种1h），傍晚将日浸的种子从水中提起淘洗后移至室内，连同袋子均匀摊在席子上，厚度不超过25cm，席子下面垫10cm厚的稻草。次日晨，再将种子悬挂在河中。如此日浸夜露3-4d，种子露白崩胸即可播种，严禁上窝催芽。如果气温较低，种子上面可以加覆盖物，但不要太厚，一般不宜超过10cm；不能用薄膜封锁捂种，易造成缺氧损种，尤其是不能用热水加温。若因气温低，日浸夜露3-4d根芽仍较短时，也不要催芽，应直接播种，湿润秧播后不塌谷，撒种后用干细土盖籽。
2.3.6坚持练芽
种子在播种前一天，要摊开晾芽,增强抗低温能力。
2.4提高秧池质量
要搞好冬前秧池熟化工作，强化秧池建设，配套沟系，施足有机肥，少施速效肥。湿润秧池在落谷前一天要做好秧板，保证第二天播种时秧板平整沉实不陷谷。
2.5强化播后管理
落谷后，要按照育秧操作规程强化管理。湿润秧板面出苗前无积水；薄膜育苗的不得“贴膏药”；旱育秧要理清沟系，能及时排灌。